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海岛棉转录因子基因GbTCP27的克隆及表达特性分析

2020-02-15分类号:Q943.2;S562

【作者】郑凯  曲延英  倪志勇  蔡永生  石颖颖  陈全家  
【部门】新疆农业大学农学院/农业生物技术重点实验室  
【摘要】为探究转录因子GbTCP27在棉花纤维发育中的作用,使用RT-PCR技术从海岛棉‘新海21号’中克隆GbTCP27,并对其进行生物信息学和表达特性分析。结果表明,该基因有1个1 017 bp的开放阅读框,编码338个氨基酸,预测分子量约为35.37 ku,等电点为9.08,分子式为C_(1549)H_(2511)N_(439)O_(483)S_(11),序列中含有一个高度保守的TCP结构域;氨基酸序列对比表明,海岛棉GbTCP27基因在进化过程中是相当保守的,蛋白序列与其他植物中的TCP蛋白序列有较高的一致性;亚细胞定位结果显示,GbTCP27属于核定位基因,推测GbTCP27可能在复制和转录的过程中发挥作用;进化树分析表明,海岛棉GbTCP27基因与亚洲棉GaTCP9基因分布在同一分支上;实时荧光定量PCR表明,GbTCP27基因在开花当天的花瓣和开花当天的胚珠中表达量最高;综上所述,GbTCP27转录因子可能参与棉花纤维起始期胚珠表皮细胞的发育。
【关键词】海岛棉  TCP  转录因子  亚细胞定位  表达特性
【基金】国家自然科学基金(31560405);; 新疆维吾尔自治区研究生科研创新项目(XJGRI2016057);; 新疆农业大学作物学重点学科发展基金(XNCDKY2017005)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
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