【摘要】以施氏鲟(Acipense rschrenckii)、西伯利亚鲟(Acipenser baerii)、达氏鳇(Huso dauricus)为研究材料，分别从线粒体基因组及核基因组两个层面进行物种分子鉴定方法研究。在线粒体基因组层面，对3种鲟鱼及未知鲟鱼种类共计119个样品的D-Loop区进行测序，通过同源序列比对，构建NJ进化树、计算群体间遗传距离，以鉴定其中30尾未知种类。在核基因组层面，利用15对微卫星标记扩增3种鲟鱼DNA，筛选出特异性标记Ls19和SX226，Ls19在施氏鲟中扩增出特异条带126 bp、130 bp，在西伯利亚鲟中扩增出特异条带139 bp、143 bp，在达氏鳇中扩增出特异条带124 bp、127 bp；SX226在施氏鲟中扩增出特异条带185 bp，在西伯利亚鲟中扩增出特异条带260 bp、273 bp、283 bp，在达氏鳇中扩增出特异条带180 bp、182 bp。通过特异条带对未知鲟鱼进行鉴定，结果显示：30尾未知鲟鱼种类中，有西伯利亚鲟17尾，施氏鲟1尾，达氏鳇1尾，达氏鳇×施氏鲟2尾，施氏鲟×达氏鳇1尾，施氏鲟×西伯利亚鲟8尾。结果表明，特异性微卫星引物Ls19和SX226可以应用于施氏鲟、西伯利亚鲟、达氏鳇的纯种及杂交种分子水平种质鉴定。