【摘要】在易驯食与不易驯食鳜转录组Unigene数据库中共预测到4809个SNP位点，其中胃蛋白酶基因 (pepsinoge, pep) 和生长激素基因 (growth hormone, gh) 均为转录组筛选获得的鳜 (Siniperca chuatsi) 驯食性状候选基因，本研究将候选基因上的多态SNP位点在易驯食和不易驯食鳜群体中进行基因分型，并与鳜驯食性状进行关联分析。在易驯食与不易驯食的鳜群体中共发现5个单核苷酸 (SNP) 多态性位点，有效等位基因 (N_(e)) 在1.1959到1.7001之间，观测杂合度 (H_(o)) 和期望杂合度 (H_(e)) 分别分布于0.1800～0.3585和0.1655～0.4160，多态信息含量 (PIC) 为0.2477，全部位点都属于中度多态性位点。结果表明SNP位点pep-A T/C中2种基因型TT和CT与鳜驯食性状成高水平显著相关 (P<0.05)，显著影响鳜驯食性状表型，其中Genotype2相关性最高，可作为最优基因型个体进行选育。本研究以鳜选育群体为实验材料，在鳜pep和gh基因中鉴定出与驯食性状呈显著关联的SNP分子标记，为加快易驯食鳜新品种的基因辅助选育提供有效的SNP分子标记。