马尾松毛虫线粒体全基因组的测定与分析
2019-12-15分类号:S763.42
【部门】中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业和草原局森林保护学重点实验室 东北林业大学林学院 云南省丽江市玉龙纳西族自治县林业局
【摘要】【目的】测定和分析马尾松毛虫线粒体基因组的特征,从线粒体基因组水平探究蛾类昆虫高级阶元的系统发育关系。【方法】采用Hi Seq X Ten测序仪测定马尾松毛虫线粒体的全基因组序列,参考鳞翅目昆虫已知线粒体基因组的全序列对其各基因进行定位和注释。采用tRNA Scan-SE 2. 0软件预测tRNA基因的二级结构。基于线粒体全基因组的核苷酸序列构建鳞翅目蛾类13个科50种昆虫的系统发育关系。【结果】马尾松毛虫线粒体基因组全长15 417 bp,A+T含量为79. 6%,包括13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和一段长度为320 bp的A+T富含区,无基因重排。13个蛋白质编码基因中,氨基酸使用较频繁的依次包括Phe、Leu、Ile、Tyr和Asn(Count>290),而Ala和Arg的使用相对较少(Count
【关键词】鳞翅目 枯叶蛾科 马尾松毛虫 线粒体基因组 系统发育
【基金】国家自然科学基金项目(31470654)
【所属期刊栏目】林业科学
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