利用SNP芯片构建甘蓝型油菜高密度遗传连锁图谱及含油量性状QTL分析
2019-11-25分类号:S565.4
【部门】云南省农业科学院经济作物研究所 临沧市农业技术推广站 玉龙县农业技术推广中心
【摘要】【目的】在云南生境下挖掘甘蓝型油菜含油量QTL位点,为高含油量性状遗传机制研究和分子标记辅助高含油量育种提供理论基础。【方法】以高含油量材料G28为母本,低含油量材料H008为父本,通过小孢子培养技术创建包含175份株系的F_1 DH群体,利用60K SNP芯片构建高密度遗传连锁图谱,结合2016-2017年丽江与临沧点DH群体含油量数据采用完备区间作图法,以LOD=2.5为阈值扫描含油量性状QTL。【结果】DH群体含油量性状呈现正态分布,表现出单向超亲分离。2个环境下共检测到6个含油量QTL,分别可解释6.29%~10.36%的表型变异。通过Blast分析将这6个QTL分别映射到参考基因组-Darmor-bzh ChrA01,ChrA10,ChrC05与ChrC08染色体物理图谱上。与前人研究比较分析推测位于C05染色体上的qOCc05.1与qOCc05.2为新的含油量性状相关的QTL。【结论】在云南生境下检测到6个含油量性状QTL并明确了其在染色体的物理区间,定位结果可用于下一步主效QTL的精细定位和分子标记辅助高含油量油菜育种。
【关键词】SNP芯片 DH系 甘蓝型油菜 含油量 QTL
【基金】国家基金科学基金(31360346);; 国家重点研发计划项目子课题(2016YFD0100202-12);; 云南省农业基础研究联合专项(2017FG001-070);; 云南省农业科学院食用油料作物育种与应用研究省创新团队(2017HC021)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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