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高粱苗期耐盐性转录组分析和基因挖掘

2019-11-16分类号:S514

【作者】董明  再吐尼古丽·库尔班  吕芃  杜瑞恒  叶凯  侯升林  刘国庆  
【部门】河北省农林科学院谷子研究所/河北省杂粮重点实验室  新疆农业科学院生物质能源研究所  
【摘要】【目的】探究高粱耐盐胁迫响应机制,挖掘高粱耐盐胁迫基因,为高粱耐盐育种提供理论基础。【方法】以高粱感盐品种L甜和耐盐品种石红137为供试材料,采用水培试验。待高粱植株长至三叶一心期,使用2%NaCl溶液对幼苗进行盐胁迫,分别设置0(对照)、1和24 h处理,每个处理3次重复。测定不同处理样品株高、根长、干物重、Na~+含量和叶绿素相对含量(SPAD值),并依托Illumina HiSeq 2000平台进行转录组测序分析。利用FPKM方法计算基因表达量,在差异表达基因检测过程中,将差异表达倍数(fold change)≥2且FDR
【关键词】高粱  盐胁迫  转录组  基因挖掘
【基金】国家自然科学基金(31660435);; 国家现代农业产业技术体系(CARS-06-13.5-A10)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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