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花椒cpSSR标记开发及在种间、种内的通用性分析

2019-11-12分类号:S573.9

【作者】李思巧  韦伊  刘洪妤  张志东  张野  王丽华  刘玉林  
【部门】西北农林科技大学林学院  四川省林业科学研究院生物技术与良种研究所  
【摘要】叶绿体基因组为母系遗传,保守性高,因此叶绿体基因组中的简单序列重复(SSR)标记可在更高分类水平上进行种质资源鉴定和群体遗传结构分析。利用TRF软件和SSR Hunter软件相结合对花椒Zanthoxylum bungeanum叶绿体基因组中的SSR位点进行筛选。结果显示:花椒叶绿体基因组中共有144个SSR位点,位点间的平均分布距离为1 100.00 bp。基于检测软件设置参数,SSR重复类型主要集中在一、三核苷酸重复,二者占SSR位点总数的91.67%。此外,随机设计合成30对SSR引物对10份花椒种质、 5份竹叶花椒Zanthoxylum armatum种质和1份日本花椒Zanthoxylum piperitum种质进行PCR扩增检测,共筛选出10对多态性引物,其中单核苷酸重复位点的多态性高于多核苷酸重复位点。本研究开发的叶绿体SSR标记可有效区分花椒、竹叶花椒和日本花椒,但在花椒种内并未检测出多态性。表明花椒叶绿体基因组的SSR标记可用于花椒属Zanthoxylum不同种间的遗传多样性分析。图2表3参19
【关键词】植物学  花椒  叶绿体基因组  简单序列重复(SSR)  多态性分析
【基金】西北农林科技大学大学生创新性实验计划项目(国家级)(201710712023);; 中央高校基本科研业务费专项资金项目(2452015167);; 国家林业局林业公益性行业科研专项(201304706)
【所属期刊栏目】浙江农林大学学报
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