【摘要】对于区域来说,科技创新效率大小往往能体现其科技创新能力强弱。本文针对不同时期前沿面无法比较问题,同时为了分析环境对科技创新效率的影响,构建考虑外部环境和异质前沿面的改进三阶段EBM-Windows模型,以期更准确评估区域科技创新效率。根据中国30个省市自治区(不包括香港、澳门、台湾、西藏的数据) 2007—2016年的科技创新效率结果,对比分析各区域效率值,结果表明在剔除环境因素和随机干扰影响后,大部分地区科技创新效率有所提升,并通过测算引起效率变动的影响因素大小,提出改进各区域科技创新效率的建议。