高粱糖转运蛋白基因家族全基因组鉴定、分类及表达分析
2019-10-28分类号:S514
【部门】中国热带农业科学院湛江实验站 广东省旱作节水农业工程技术研发中心
【摘要】糖转运蛋白(Sugar transporter protein,STP)基因家族在植物单糖分配中具有重要作用,并参与植物生长和发育过程中的许多代谢进程。为探究STP基因家族在高粱生长发育中的潜在功能,对高粱STP基因家族进行了全基因组鉴定、分类和组织表达分析。从高粱基因组中共鉴定出19个包含Sugar_tr结构域的STP基因,不均匀分布于9条染色体上,其中有4个基因位于基因组重复区。19个SbSTP根据其系统发育特征可以分为5组,同组的家族成员具有相同或类似的基序类型和排列顺序,但在内含子和外显子数量上存在较大差异。RNA-Seq数据分析显示,至少有18个SbSTP基因可以表达,不同的基因在不同的组织中具有不同的表达模式,其中SbSTP11特异性在花中表达,SbSTP4、SbSTP5在特定组织中受ABA和PEG的诱导表达。为进一步研究单个SbSTP基因的生物学功能,挖掘SbSTP家族的应用潜力奠定了基础。
【关键词】高粱 STP 基因家族 系统进化 表达分析
【基金】广东省自然科学基金项目(2016A030307007);; 中国热带农业科学院科技创新团队专项资金(1630102017002)
【所属期刊栏目】华北农学报
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