基于分子对接技术的拟南芥植酸酶的水解特性
2019-10-25分类号:Q943.2
【部门】植物激素与生长发育湖南省重点实验室 中国科学院植物研究所
【摘要】采用生物信息学、同源建模、分子对接等方法,对拟南芥植酸酶(ATMINPP)的功能结构及其与植酸的分子对接模式进行了预测。结果表明:ATMINPP由487个氨基酸组成,其二级结构由18个α螺旋、6个β折叠、伸展片段和无规则卷曲等4个主要部分构成;保守半胱氨酸在螺旋结构之间形成4个二硫键;ATMINPP蛋白有2个结构域(α/β–结构域和α–结构域),活性位点位于2个结构域的中间;对接时,带负电的植酸结合在ATMINPP带正电的亲水性口袋内;保守序列RHGARYP中的His 66对植酸氢键所结合的磷酸基团进行亲核攻击,形成中间复合物,中间复合物水解得到磷酸和磷酸肌醇衍生物,His 343为解离基团氧原子提供质子,使得磷酸基团解离。
【关键词】拟南芥植酸酶 水解 生物信息学 同源建模 分子对接 植酸
【基金】国家自然科学基金项目(31671777、31871714);; 长沙市科技局计划项目(KQ1801024)
【所属期刊栏目】湖南农业大学学报(自然科学版)
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