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雨生红球藻UVR8的基因克隆和生物信息学分析

2019-09-28分类号:Q943.2

【作者】张宏江  杭伟  马浩天  王晓丹  李润植  崔红利  
【部门】山西农业大学分子农业与生物能源研究所  
【摘要】[目的]获得雨生红球藻中紫外抗性蛋白(Uv resistance locus 8,UVR8)的cDNA序列全长,并进行生物信息分析。[方法]以雨生红球藻为研究对象,通过同源克隆方法获得紫外抗性蛋白UVR8的cDNA序列全长,并通过生物信息手段对其理化性质、蛋白结构及系统进化进行分析。[结果]序列分析表明,HaeUVR8的编码区全长为1554 bp,共编码517个氨基酸,预测理论等电点为5.56,理论分子量为54.31 kD。通过BLASTp分析,与拟南芥中UVR8的相似性达到51%,与莱茵衣藻中UVR8的相似性达到59%。通过蛋白保守结构域分析,HaeUVR8蛋白中存在UVR8蛋白的典型结构域,包括7个叶片螺旋结构和保守的色氨酸残基。系统进化分析表明,高等植物和真核绿藻来源UVR8s有共同祖先。[结论]本研究首次获得雨生红球藻中编码UVR8的基因序列,发现其结构与高等植物UVR8相似,暗示二者可能有相似的作用机制,为雨生红球藻中UVR8的表达、功能研究奠定基础,同时为解析雨生红球藻适应紫外光的分子机制提供线索。
【关键词】紫外抗性蛋白  cDNA全长  结构域  系统进化  雨生红球藻
【基金】国家海洋局海洋生物活性物质与现代分析技术重点实验室开放基金(MBSMAT-2016-03);; 博士后面上资助基金(2018M631768);; 国家“948”项目(2014-Z39);; 山西省煤基重点科技攻关项目(FT-2014-01);; 山西省重点科技项目(201603D312005)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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