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25个鸡品种DMB2基因序列比较分析

2019-09-24分类号:S831.2

【作者】刘本帅  郑圣晗  原小雅  陈颖  张莘  王统苗  陈博雯  张扬  王志秀  常国斌  陈国宏  
【部门】扬州大学动物科学与技术学院  
【摘要】[目的]DMB2(major histocompatibility complex,class Ⅱ,DM beta 2)基因是鸡MHCⅡ类的典型基因座,通过比较不同鸡品种的DMB2基因序列探究该基因对鸡的免疫反应和抗病性的作用和意义。[方法]本研究对25个不同鸡种的DMB2基因序列进行目标捕获测序,以NCBI上Gallusgallus的DMB2基因序列作为参考序列,通过MEGA6软件进行序列比对分析,筛选出不同鸡种DMB2基因序列上的SNPs和Indels位点以及氨基酸的变化,并根据基因序列的差异构建系统进化树,探究不同鸡种的同源性。[结果]结果表明DMB2基因表现其遗传多态性的同时呈现出较高的保守性,外显子上突变和插入缺失较少。进化树分析显示抗病性较强的鸡种广西黄鸡、SPF-来航鸡、藏鸡、雪山草鸡的同源性较高。[结论]不同鸡种中DMB2基因呈现出较高的保守性,在进化过程中不易发生突变,该基因在鸡的免疫反应中具有重要作用。
【关键词】鸡  DMB2基因  SNPs  Indels  进化树
【基金】国家科技支撑计划“鸡种质资源培育与创新利用”(2015BAD03B03);; 江苏省六大人才高峰项目资助“禽类PIWI蛋白在配子形成中表遗传调控机制研究”(2015-NY-019)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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