两种弧菌感染大黄鱼免疫相关基因的SNP位点分析
2019-09-15分类号：S917.4
【部门】上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室 宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室
【摘要】为了探究大黄鱼(Larimichthys crocea)免疫相关基因的SNP与弧菌抗性关系,分别利用鳗弧菌(Vibrio anguillarum)和副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)人工感染大黄鱼。对感染前后抗感群体的转录组进行高通量测序、筛选并分析其抗病差异:(1)筛选氨基酸的非同义突变SNP位点在抗鳗弧菌组有17个,而抗副溶血弧菌组的有28个;(2)一代测序验证结果发现,染色体NW_011323507.1上白细胞介素6受体基因(IL-6R)第91 196位碱基G突变为C,导致缬氨酸突变为亮氨酸,该位点G/C在抗鳗弧菌组、对照组样本之间突变基因型CC频率分别为12.5%和0,呈显著性差异(P
【关键词】鳗弧菌 副溶血弧菌 大黄鱼 转录组 免疫基因 SNP
【基金】国家自然科学基金(31872546)
【所属期刊栏目】上海海洋大学学报
文献传递
