西江流域卷口鱼线粒体D-loop序列的遗传多样性分析
2019-08-29分类号:S917.4
【部门】广西遗传育种与健康养殖重点实验室广西水产科学研究院
【摘要】为研究西江流域广西境内卷口鱼(Ptychidio jordani)种群的遗传变异情况,自广西境内6个江段采集了139尾样本,采用PCR与DNA测序技术分析其线粒体D-loop序列的遗传多样性及群体历史动态;139条D-loop序列长度均为725 bp,碱基组成A+T (65.7%)远远高于C+G (34.3%),共检测到变异位点25个,转颠换比R值为11.5。139尾样本共定义23个单倍型。单倍型的NJ系统树以及网络结构图显示,23个单倍型间有2个明显分支,不同地理群体来源的单倍型混杂分布在2个分支中,未能观察到明显的地理聚群。6个群体遗传多样性较好,单倍型多样性H_(d)=0.71585~0.92063,核苷酸多样性P_(i)=0.00173~0.00668,遗传分化极其显著(遗传分化系数F_(st)=0.36737,P
【关键词】卷口鱼 D-loop 遗传多样性 遗传分化 西江流域
【基金】公益性行业(农业)科研专项经费项目(201303048);; 广西自然科学基金重大项目(2013GXNSFEA053003)共同资助
【所属期刊栏目】渔业科学进展
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