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不同光周期条件下谷子株高的全基因组关联分析

2019-08-28分类号:S515

【作者】贾小平  张博  全建章  李剑峰  王永芳  袁玺垒  
【部门】河南科技大学农学院  河北省农林科学院谷子研究所国家谷子改良中心  
【摘要】为揭示控制株高的遗传机理,为开展理想株型标记辅助选择育种奠定基础,在海南、洛阳、吉林3个不同种植区光周期条件下调查了98份谷子材料的株高,并对98份谷子材料进行基因组重测序,开展单核苷酸多态性(SNP)位点标记与株高的全基因组关联分析。结果表明:不同光周期条件下谷子株高的变异在58. 5~169. 3 cm,广义遗传力为0. 501,且随着日照时间的延长,谷子株高呈递增的趋势。基因组重测序获得了4 482 208个高质量的SNP位点,主成分分析将98份谷子材料分为3个亚群,连锁不平衡(LD)分析发现谷子基因组LD衰减距离为47. 5 kb。全基因组关联分析获得10 703个与株高关联的SNP位点(P
【关键词】谷子  光周期  重测序  株高  全基因组关联分析
【基金】国家自然科学基金项目(31471569)
【所属期刊栏目】华北农学报
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