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IGF-1R基因SNPs检测及其与水貂生长性状的关联分析

2019-08-28分类号:S865.22

【作者】宋姗姗  刘宗岳  丛波  刘琳玲  宋兴超  彭英华  
【部门】中国农业科学院特产研究所吉林省特种经济动物分子生物学省部共建国家重点实验室  
【摘要】为了研究胰岛素样生长因子1受体(IGF-1R)基因外显子2和外显子11的单核苷酸多态性,分析该基因变异与水貂生长性状的关联性,以红眼白水貂、金州黑水貂和咖啡水貂共计235个样本的血液基因组DNA为模板,采用PCR产物克隆和Sanger测序技术,筛查IGF-1R基因SNP位点,将差异位点与不同种群的水貂生长性状进行关联分析。结果表明,红眼白、金州黑水貂的外显子2和外显子11上检测到2个SNPs:c. 207G> A和c. 1782G> A;咖啡水貂在外显子2上检测到2个SNPs:c. 207G> A和c. 218T> A,在外显子11检测到1个SNPs:c. 1782G> A。c. 207G> A和c. 1782G> A都属于无义突变。c. 218T> A位点属于有义突变,氨基酸发生改变,脯氨酸变为精氨酸。关联分析表明:c. 207G> A与金州黑水貂和咖啡水貂体长性状显著相关(P A与咖啡水貂的体长和体质量显著相关(P A位点GG基因型是水貂体长的优势基因型;合并基因型GGGA和GGAA可能是影响金州黑水貂体长体质量的有利基因型,认为IGF-1R基因可能是影响水貂生长性状的候选基因。
【关键词】水貂  IGF-1R基因  单核苷酸多态性  生长性状  关联分析
【基金】吉林省自然科学基金项目(20180101021JC);; 中国农业科学院科技创新工程基金项目(20140204066NY)
【所属期刊栏目】华北农学报
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