【摘要】乡村振兴提出产业兴旺的基本要求,实现产业兴旺的重要途径之一是促进小农户与现代农业的有机衔接,农民合作社正是小农户与现代农业衔接的重要组织载体。在农民合作社运行过程中,经济环境对其组织治理至关重要。本研究在理论分析基础上,以苹果合作社为案例运用三阶段DEA模型测度农民合作社治理效率并分析经济环境对合作社治理效率的影响。研究表明:环境因素对农民合作社治理效率具有显著影响。农林牧渔总产值、财政农林水支出和农业人口比例的增加以及苹果产业规模的扩大可以提高农民合作社治理效率;在剔除环境因素和随机因素影响后,农民合作社治理的总效率略有上升,纯技术效率有所增长,规模效率略有下降,多数农民合作社仍处于规模报酬递增阶段,并提出优化农民合作社治理环境,提高其治理效率的对策建议。