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二倍体和四倍体泥鳅qRT-PCR分析中内参基因优选

2019-08-20分类号:S917.4

【作者】罗双双  高泽霞  冯兵  张曼曼  曹文怡  周小云  
【部门】华中农业大学水产学院/农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室  
【摘要】为筛选在泥鳅中稳定表达的内参基因,以确保泥鳅基因表达分析结果的可靠性,选取ACTB、TUBA、EF1A、GAPDH、TUBB和18SrRNA 6个常用的内参基因作为候选内参基因,分别用BestKeeper、geNorm、NormFinder、ΔCt和RefFinfer软件分析这6个基因在二倍体和四倍体泥鳅胚胎发育阶段、成鱼组织间以及倍性间表达的稳定性。结果显示,在胚胎发育各阶段,TUBB和TUBA的表达最稳定,可作为胚胎发育阶段qRT-PCR分析的内参基因;其中,TUBB在泥鳅倍性间的表达差异不显著,因此,可作为泥鳅胚胎发育中跨倍性qRT-PCR研究的内参基因。在成鱼各组织中,ACTB和18SrRNA的表达最稳定,可用作组织间qRTPCR分析的内参基因;其中,18SrRNA在倍性间的组织表达差异不显著,因此,可作为泥鳅组织间跨倍性qRTPCR的内参基因。
【关键词】泥鳅  二倍体  四倍体  多倍体鱼类  表型变异  基因表达变异  qRT-PCR  内参基因  稳定表达
【基金】国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”重点专项(2018YFD0900205)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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