乙型脑炎病毒感染猪睾丸细胞的miRNA表达谱差异分析
2019-07-17分类号:S858.28
【部门】江苏省农业科学院动物免疫工程研究所/国家兽用生物制品工程技术研究中心 南京市栖霞区动物卫生监督所 江苏省动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心 江苏省食品质量安全重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地
【摘要】[目的]本试验旨在分析乙型脑炎病毒(JEV)感染猪睾丸(ST)细胞和正常ST细胞miRNA差异表达谱,以探索miRNA在JEV感染过程中的作用及其调控机制。[方法]分别提取正常ST细胞和JEV感染8 h后的ST细胞总RNA,利用高通量测序技术检测分析ST细胞中的miRNA表达谱并进行差异分析。使用miRanda软件对表达差异显著miRNA的靶基因进行预测并对靶基因进行GO分析。选取6个显著性差异表达的miRNA通过RT-qPCR进行验证。[结果]与正常ST细胞相比,JEV感染后的ST细胞有112个差异表达miRNA,其中80个miRNA上调表达,32个miRNA下调表达。经RT-qPCR方法验证6个差异表达的miRNA结果与高通量测序结果一致。差异表达miRNA靶基因的生物学功能相对集中在细胞代谢、细胞黏附等生物过程。[结论]检测和分析JEV感染后猪睾丸细胞的miRNA表达谱,获得了大量的与JEV感染相关的miRNA表达谱数据,为揭示JEV感染生殖系统致病机制提供了有效的数据和理论基础。
【关键词】乙型脑炎病毒 猪睾丸细胞 miRNA 高通量测序
【基金】国家自然科学基金青年科学基金项目(31802220)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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