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云南金花茶SSR-PCR反应体系的建立与优化

2019-06-25分类号:S685.14

【作者】李显煌  高丽云  王娟  张贵良  唐军荣  叶鹏  雷瀚  辛培尧  
【部门】西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室  西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室  毕节市林业科学研究所  云南省大围山国家级自然保护区河口管理分局  西南林业大学国家林业和草原局西南地区生物多样性保育重点实验室  
【摘要】以云南金花茶为试验材料,利用试剂盒法、SDS法及CTAB法3种方法提取其DNA,并对3种方法的提取结果进行比较;经初筛合成云南金花茶EST-SSR引物,并对影响SSR-PCR体系的Mg~(2+)、Taq DNA聚合酶、dNTP、引物及模板DNA这5个因素进行L_(16)(45~)正交实验,以期建立较为稳定的云南金花茶SSR-PCR体系。试验结果表明:试剂盒法提取得到的云南金花茶DNA质量最好且符合SSR分子标记试验。各因素对PCR扩增效果的影响程度为:Mg2+>引物> Taq DNA聚合酶> dNTP>模板DNA。试验最终确定的金花茶SSR-PCR最佳反应体系(20μL)为:2.0μL Taq Buffer、1.5μL Mg2+(25 mmol/L)、0.3μL dNTP(10 mmol/L)、0.2μL Taq DNA聚合酶(5 U/μL)、前后引物各0.4μL(10μmol/L)、0.5μL模板DNA(50 ng/μL)、14.7μL ddH_2O。建立和优化云南金花茶SSR反应体系,可为云南金花茶不同种群的遗传变异研究提供基础。
【关键词】云南金花茶  SSR-PCR  体系建立  优化
【基金】云南省林学一级学科博士点建设项目;; 云南省林业厅国家公园试点建设项目(2136299);; 云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室开放基金项目(YNGB201503)
【所属期刊栏目】中南林业科技大学学报
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