苦荞NAC基因家族的生物信息学分析
2019-06-25分类号:S517
【部门】贵州师范大学荞麦产业技术研究中心 贵州师范学院生物科学学院
【摘要】以苦荞基因组数据库为基础,利用比对程序,经鉴定和筛选,共获得72个苦荞NAC家族基因的序列,对其进行生物信息学分析。基因结构分析表明,除FtPinG0002967400.01.T01基因外,苦荞NAC家族其余71个基因均含有内含子。蛋白质理化性质预测分析表明,72条蛋白序列具有NAC结构域。72个NAC基因共有7个保守基序,在苦荞8条染色体上均有分布。有33个NAC基因在种子发育过程中差异表达。系统进化分析表明,苦荞NAC蛋白序列与拟南芥的可以分为9个亚家族。
【关键词】苦荞 NAC基因家族 生物信息学
【基金】国家自然科学基金项目(31760419,31660366,31701494);; 贵州省科技计划项目(黔科合LH字[2017]7364号,黔科合LH字[2016]7205号,黔科合LH字[2017]7355号,黔科合LH字[2017]7359号);; 贵州省荞麦种质资源保育及创新重点实验室建设基金项目(黔教合KY字[2017]002)
【所属期刊栏目】湖南农业大学学报(自然科学版)
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