鲤浮肿病病毒环介导等温扩增(LAMP)检测方法的建立
2019-06-12分类号:S943
【部门】水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学) 中国水产科学研究院长江水产研究所
【摘要】本研究针对鲤浮肿病病毒(carp edema virus, CEV)基因组核蛋白编码基因P4a的序列,设计2对特异性引物,以克隆构建的重组质粒为标准模板,通过优化反应体系中引物浓度组合、Mg~(2+)浓度、dNTPs浓度、反应温度和扩增时间等参数,建立了CEV环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法。结果表明,CEV-LAMP方法的最佳反应温度为62℃,引物浓度组合为引物F3/B3 0.2μmol/L,引物FIP/BIP 1.2μmol/L, Betaine0.7 mol/L, Mg~(2+) 8.0 mmol/L, dNTPs 1.2 mmol/L,反应时间60 min。反应产物经凝胶电泳呈现梯型条带,添加SYBR Green I荧光染料后,呈现明显的绿色阳性反应。CEV-LAMP法灵敏度高,最低检测限为10 copies/μL,较常规PCR法灵敏度高100倍; CEV-LAMP法特异性强,与锦鲤疱疹病毒(KHV)、鲤疱疹病毒Ⅱ型(CyHV-2)、鳜传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)及鲤春病毒血症病毒(SVCV)无交叉反应。CEV-LAMP应用于患病鲤样本检测结果准确,简便快速,可为鲤浮肿病的现场诊断与防控提供技术支撑。
【关键词】鲤浮肿病病毒 核蛋白编码基因P4a 环介导等温扩增 检测 优化
【基金】国家大宗淡水鱼产业技术体系专项资金项目(CARS-45-16);; 中国水产科学研究院基本科研业务费专项(2017HYZD1005);; 湖北省科技支撑计划项目(2015BBA234)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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