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小麦细胞分裂素受体基因TaHK1的生物信息学及表达特性分析

2019-06-11分类号:S512.1

【作者】孙丽静  赵慧  吕亮杰  张颖君  胡梦芸  刘茜  李辉  
【部门】河北省农林科学院粮油作物研究所河北省作物遗传育种实验室  河北科技大学生物科学与工程学院  
【摘要】细胞分裂素在植物发育和应对盐渍、干旱等非生物胁迫的过程中均扮演着重要的角色。为了研究小麦细胞分裂素受体基因的功能,利用已知的拟南芥细胞分裂素受体基因AHK4(At2g01830)为参考序列,使用同源克隆的方法从小麦基因组中得到同源性最高的基因TRIAE_CS42_4DS_TGACv1_362760_AA1181940(Ensembl Plants),命名为TaHK1。生物信息学分析表明,TaHK1位于小麦4D染色体上,编码的蛋白由996个氨基酸组成,分子质量为109. 70 ku,等电点为5. 71; TaHK1蛋白二级结构由α-螺旋、无规则卷曲、延伸链和β-转角4种构象组成;亚细胞定位预测该蛋白定位于细胞膜的可能性较大,跨膜结构域预测其具有2个跨膜域;蛋白保守结构域分析发现,TaHK1具有典型的细胞分裂素受体的完整结构域,并且含有87个磷酸化位点。表达谱分析显示,TaHK1在根、茎、叶、雄蕊和小穗等各个组织有广泛表达;此外,TaHK1表达量受低磷胁迫和多种病原菌侵染诱导,而受干旱胁迫抑制,推测其在小麦生长发育、抵御干旱胁迫和病原菌侵染过程中可能发挥重要作用。
【关键词】小麦  细胞分裂素受体  TaHK1  生物信息学分析  基因表达
【基金】河北省自然科学基金面上项目(C2019301089);; 河北省农林科学院科学技术研究与发展计划项目(2018060304);; 国家转基因生物新品种培育重大专项(2016ZX08002005-002);; 河北省现代农业产业技术体系小麦产业创新团队项目(HBCT2018010201);; 河北省现代农业科技创新工程项目(494-0402-YBN-RDC4;494-0402-JBN-C7GQ);; 河北科技大学博士科研启动基金项目(QD201419)
【所属期刊栏目】华北农学报
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