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基于转录组测序技术筛选花■卵巢发育相关基因

2019-05-28分类号:S917.4

【作者】刘慧芬  卢良盛  王静  周传江  顾钱洪  马晓  冯军厂  聂国兴  李学军  
【部门】河南师范大学水产学院河南省水产动物养殖工程技术研究中心  
【摘要】为筛选影响花■卵巢发育相关的基因,采用Illumina Hiseq技术对花■脑、卵巢和肝脏组织进行高通量转录组测序。结果显示,3个组织分别产生了49 484 132、47 540 538和50 622 304个clean reads,组装后共获得了99 878个unigenes,平均长度为1 430 bp。DE seq分析发现,在脑vs.卵巢组中特异性表达的基因数为2 305个,脑vs.肝脏组中特异性表达的基因数为839个,卵巢vs.肝脏组中特异性表达的基因数为1 474个,3个比较组共有的差异表达基因数为860个。GO分析发现,上述差异表达基因主要集中在初级代谢过程(primary metabolic process)、单细胞过程(single-organism process)、有机物代谢过程(organic substance metabolic process)等生物学过程中。KEGG pathway分析显示,一些与卵巢发育和减数分裂相关的信号通路得到了显著富集,如GnRH信号通路、类固醇激素合成、TGF-β信号通路、卵母细胞减数分裂等代谢通路。本研究结果丰富了花■的基因资源,可为花■的繁殖生物学研究提供基础数据。
【关键词】花■  卵巢发育  转录组
【基金】河南省创新型科技团队支持计划(CXTD2016043);; 河南省科技攻关重点项目(162102110147;182102110383);; 农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室开放课题;; 河南师范大学博士科研启动课题(qd15186),河南师范大学校青年基金~~
【所属期刊栏目】水产学报
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