结合线粒体D-loop序列和SSR标记对宝石鲈养殖群体遗传多样性的分析
2019-05-15分类号:S917.4
【部门】农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室中国水产科学研究院珠江水产研究所 上海海洋大学
【摘要】采用线粒体D-loop序列及SSR标记分析广东4个宝石鲈(Scortum barcoo)养殖群体的遗传多样性。D-loop序列分析显示,长度为598 bp的D-loop片段上有14个多态性位点,共定义8个单倍型。4个群体单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数分别为0.000 0~0.543 5、0.000 00~0.001 76,表明4个群体遗传多样性水平均较低。利用11个SSR位点分析显示,4个群体期望杂合度(H_e)=0.396~0.516、PIC=0.320~0.420,说明各群体遗传多样性处于中低水平。虽然二种方法获得的遗传分化指数F_(ST)上存在差异,分别为0.403 5(D-loop)和0.044 5(SSR),但二种分析结果均显示4个广东群体的遗传多样性较低、亲缘关系较近,因此有必要引进原种以丰富国内养殖群体的遗传多样性。
【关键词】宝石鲈(Scortum barcoo) D-loop 微卫星 遗传多样性 遗传距离
【基金】现代农业产业技术体系建设专项(CARS-46);; 中国水产科学研究院基本科研业务费资助(2017HY-XKQ0208);; 广东省自然科学基金-博士启动基金(2015A030310154)
【所属期刊栏目】淡水渔业
文献传递