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辣椒Whirly基因家族的鉴定及表达分析

2019-04-28分类号:S641.3

【作者】吕艳艳  魏小春  赵艳艳  原玉香  王志勇  杨双娟  郑小兰  姜俊  李艳  张梦园  姚秋菊  张强  张晓伟  
【部门】河南省农业科学院园艺研究所  郑州大学生命科学学院  驻马店市农业科学院  
【摘要】为了探索辣椒Whirly基因家族成员的功能和进化关系,通过生物信息学分析了其基因结构、保守基序、进化关系及表达模式,通过荧光定量PCR测定其在脱落酸、高温、低温、疫病等胁迫下的表达量。结果表明,从辣椒CM334中鉴定了2个Whirly基因家族成员,CaWHY1和CaWHY2。辣椒CaWHY1和CaWHY2同其他物种Whirly基因理化性质相比,差别不大,结构相似性高,CaWHY2基因和番茄的SlWHY2基因结构完全一样,在系统进化树中聚在一起。CaWHY1与SlWHY1聚在一起,但它们的基因结构不同,说明Whirly蛋白在进化过程中,结构保守。表达模式分析发现,CaWHY1和CaWHY2在辣椒CM334中均能表达,但在不同组织和果实发育时期的表达水平存在差异。CaWHY1和CaWHY2在不同胁迫处理下受到不同程度的诱导,其中CaWHY1明显受疫病的诱导,CaWHY2在低温处理和脱落酸胁迫下的表达量变化趋势相反。由此可知,Whirly基因家族在辣椒的生长发育中起调控作用,在各种逆境胁迫中也发挥一定作用。
【关键词】辣椒  Whirly基因家族  全基因组鉴定  胁迫  表达分析
【基金】国家大宗蔬菜产业技术体系豫北综合试验站项目(CARS-23-G-16);; 特色蔬菜产业技术体系郑州综合试验站项目(CARS-24-G-13);; 农业部黄淮海(河南)蔬菜观测站项目(10205020)
【所属期刊栏目】华北农学报
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