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基于高通量测序的藜麦连作根际土壤微生物多样性研究

2019-04-28分类号:S154.3;S519

【作者】董艳辉  于宇凤  温鑫  王亦学  聂园军  侯丽媛  李亚莉  刘江  任元  王育川  曹秋芬  吴慎杰  王斌  秦永军  
【部门】山西省农业科学院生物技术研究中心  农业部黄土高原作物基因资源与种质创新重点实验室  山西省农业科学院农业资源与经济研究所  山西省农业科学院农作物品种资源研究所  山西省农业科学院农业环境与资源研究所  
【摘要】为了揭示连作藜麦土壤细菌群落结构和多样性的变化,采用高通量测序技术(Illumina-MiSeq)对不同处理(种植1 a、种植2 a)的连作藜麦根际土壤细菌进行16S rRNA基因V4区测序。结果表明,种植1 a较种植2 a的藜麦根际土壤细菌群落丰度和多样性指数都要高,其中,种植1 a较种植2 a的藜麦Chao1指数平均值增加16.4%,ACE指数平均值增加22.9%,Shannon指数平均值增加2.3%;菌群的分类学组成分析结果表明,重茬种植后,伦茨氏菌属、溶杆菌属、中慢生根瘤菌属、丛毛单菌属多样性增多;分枝杆菌属、藤黄单胞菌属、芽单胞菌属、浮霉状菌属等细菌多样性减少。功能预测分析表明,重茬种植后,编码细胞膜转运的功能基因、编码翻译、复制和修复的功能基因、编码外源性物质降解和代谢、多糖生物合成和代谢的功能基因大量减少,编码核苷酸代谢、萜类化合物的代谢、辅因子和维生素的代谢等功能基因少量减少;而编码信号转导和脂类代谢的功能基因有少量增加。
【关键词】藜麦  连作  高通量测序  根际土壤  生物多样性
【基金】山西省农科院博士基金项目(YBSJJ1611);山西省农科院特色农业攻关项目(YGG17065);山西省农科院院县共建项目(YCX2018D2T05);山西省农科院科技创新项目(YCX2018P2T01);; 山西省科技厅政府购买公共服务项目;; 农业部黄土高原作物基因资源与种质创新重点实验室子课题
【所属期刊栏目】华北农学报
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