【摘要】首先利用DEA-Malmquist指数分解法测度2006—2015年中国30个省级行政区的创新效率变动,同时使用C-D生产函数计算出各地区的要素市场扭曲程度。在此基础上,构建动态面板数据模型,运用两步系统GMM方法实证检验要素市场扭曲与创新效率之间的关系。研究发现:要素市场扭曲主要通过阻碍技术进步抑制创新综合效率的提升,而与创新资源配置效率之间呈显著的倒"U"型非线性关系,即当要素市场扭曲超过一定程度后将会对配置效率产生抑制作用;高新技术产业的发展、良好的通讯基础设施有助于创新效率的提高,而政府干预、外商直接投资和劳动力素质则显著抑制了创新效率的提升。