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拟穴青蟹不同发育时期胚胎基因表达的内参基因的筛选

2019-03-12分类号:S917.4

【作者】吕梁  张子平  万海付  孙玉龙  王艺磊  
【部门】集美大学水产学院农业部东海海水健康养殖重点实验室  福建农林大学动物科学学院  
【摘要】为获得适用于研究拟穴青蟹(Scylla paramamosain)不同发育时期胚胎基因表达的内参基因,本研究采用3个内参基因筛选软件geNorm、NormFinder及BestKeeper对微管蛋白α1A(Tuba1a)、核糖体蛋白L13(Rpl13)、泛素(UBQ)、核糖体蛋白S6激酶(Rps6)、精氨酸激酶(Ak)、3-磷酸甘油脱氢酶(gapdh)、28S核糖体RNA(28S)、18S核糖体RNA(18S)和延伸因子1A基因(EF-1α)等9个常用候选内参基因在拟穴青蟹不同发育时期胚胎的表达稳定性进行分析。geNorm分析表明, EF-1α和Rpl13的表达稳定性最高,并且采用2个内参基因同时校正目标基因的定量结果可以达到最优效果; NormFinder分析表明, gapdh和EF-1α是9个候选内参基因中表达最稳定的; BestKeeper分析表明,gapdh的标准偏差和变异系数是9个候选基因中最低的。综合3个内参基因筛选软件,可以选用EF-1α,或选用EF-1α和gapdh双内参同时校正拟穴青蟹不同胚胎发育时期各基因的表达情况。
【关键词】拟穴青蟹  荧光定量PCR  内参基因  稳定性
【基金】国家自然科学基金项目(41676161; 31672681; 31472266)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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