团头鲂低氧耐受相关SNPs标记的开发
2019-01-30分类号:S917.4
【部门】华中农业大学水产学院 广东佛山市南海百容水产良种有限公司
【摘要】为寻找耐低氧相关SNPs分子标记辅助团头鲂优良品种选育,利用团头鲂低氧耐受和敏感群体的转录组数据,进行SNPs位点的开发和鉴定,获得52 623个可能的SNPs位点,其中碱基转换和颠换型位点分别占57.4%(30 192个)和31.9%(16 802个);同义SNPs占编码区总SNPs的99.7%,非同义SNPs仅有32~35个;使用PCR-RFLP技术对筛选出的5个非同义的多态性SNPs进行耐低氧性状关联分析。结果显示,Plin2-A1157G和Hif-3α-A2917G位点的SNPs在团头鲂亲本群体中与低氧耐受性状显著相关,但在子代群体中却与低氧耐受性状无显著相关性。这说明亲代中筛选出的分子标记并不一定适用于子代群体,在利用分子标记辅助育种时需要考虑标记在子代中的有效性。
【关键词】团头鲂 低氧 SNP 性状关联分析
【基金】国家自然科学基金项目(31872542);; 中央高校基本业务费专项(2013PY067)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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