团头鲂hepcidin基因单核苷酸多态性及与抗病性状的相关性
2019-01-30分类号:S917.4
【部门】华中农业大学水产学院/农业农村部淡水生物繁育重点实验室
【摘要】为了解hepcidin(铁调素)基因的多态性及其与抗病性状的相关性,以团头鲂(Megalobrama amblycephala)为研究对象,从公共数据库中获得hepcidin基因序列,对团头鲂进行嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)人工感染来区分易感和抗病个体,采用PCR扩增及测序技术筛选hepcidin基因序列中的SNP(单核苷酸多态,single nucleotide polymorphisms)位点,对SNP位点运用高分辨率熔解曲线法(high-resolution melting,HRM)进行分型,分析其多态性及与抗病性状之间的关系。结果在hepcidin基因上共筛选出2个SNP位点,其中1个位点位于内含子部分,1个位于3′非编码区。经过统计分析发现,位于3 371bp(A/G)的这一SNP位点的基因型频率和等位基因频率在易感和抗病组间差异极显著,位于217bp(A/G)位点的基因型频率和等位基因频率在易感组和抗病组间差异显著。据此推测hepcidin的这2个SNP位点多态性与团头鲂抗病性状相关。
【关键词】团头鲂 铁调素基因 SNPs 抗病 嗜水气单胞菌
【基金】国家自然科学基金项目(31572613);; 中央高校基本科研业务费专项(2662015PY134)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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