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猪PKM2基因的序列分析与组织表达及亚细胞定位

2019-01-30分类号:S828

【作者】赵为民  涂枫  方晓敏  王学敏  付言峰  李碧侠  周李生  任守文  
【部门】江苏省农业科学院畜牧研究所  农业部种养结合重点实验室  江苏省农业种质资源保护与利用平台  
【摘要】运用RT–PCR技术克隆猪PKM2基因的编码区序列,对该序列进行生物信息学分析,研究PKM2基因的组织表达及亚细胞定位。结果显示:猪PKM2基因CDS全长1 596 bp,编码531个氨基酸;预测其蛋白相对分子质量为5.79×104,等电点为7.96,含有多个磷酸化位点,为稳定蛋白;PKM2蛋白含有丙酮酸激酶家族的barreldomain和alpha/beta domain 2个结构域,其蛋白二级结构中α–螺旋和无规则卷曲占主要类型;猪PKM2蛋白序列在物种间非常保守,系统进化树分析表明,该蛋白与兔的亲缘关系最近;组织表达显示,猪PKM2基因在肾、小肠中相对高表达,而在肝脏与肌肉中相对低表达;亚细胞定位显示,PKM2蛋白在猪3D4/21和PK15细胞中表达于细胞质,而不表达于细胞核。
【关键词】猪  PKM2基因  序列分析  组织表达  亚细胞定位
【基金】国家生猪现代产业技术体系南京综合试验站(CARS–35);; 江苏省农业科技自主创新资金项目(CX(17)2002);; 江苏省农业科学院基本科研业务专项(ZX(15)4002)
【所属期刊栏目】湖南农业大学学报(自然科学版)
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