皮革肾岛衣一个聚酮合酶基因的克隆与鉴定
2019-01-18分类号：Q78
【部门】云南省林业科学院/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室
【摘要】通过对地衣型真菌皮革肾岛衣转录组数据的分析,挖掘出1条非还原型聚酮合酶基因,通过RT-PCR首次克隆得到该基因的cDNA全长(NpPKS2),并通过生物信息学手段分析其基因和蛋白氨基酸序列,采用荧光定量PCR技术分析该基因在不同培养基上的表达情况.结果显示:NpPKS2基因全长6 249 bp,编码2 082个氨基酸;生物信息学分析显示该基因编码1种非还原型聚酮合酶,结构域顺序为SAT-KS-AT-PT-ACP-TE,根据聚类分析和结构域分析,推断NpPKS2为苔色酸合成酶;荧光定量分析显示地衣型真菌皮革肾岛衣中的NpPKS2基因用BMG培养基培养时表达量最高.
【关键词】皮革肾岛衣 非还原型聚酮合酶 生物信息学 基因表达
【基金】国家自然科学基金项目(31860177);; 云南省应用基础研究计划面上项目(2016FB055);; 云南省林业科学院创新基金项目(QN2018-01)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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