斑马鱼早期胚胎发育囊胚sphere时期的蛋白组学研究
2019-01-15分类号:S917.4
【部门】海洋生物科学国际联合研究中心(上海海洋大学中国科学技术部) 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室(上海海洋大学) 水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学)
【摘要】斑马鱼(Danio rerio)早期胚胎发育囊胚时期是胚胎发育过程的关键时期,利用i TRAQ蛋白质质谱分析技术,检测斑马鱼早期胚胎发育过程中囊胚sphere时期的蛋白质表达情况,并分析该时期表达的蛋白质的相应功能和参与调控的生物过程。以野生型斑马鱼发育至sphere时期即4 hpf的胚胎为样本,利用i TRAQ标记与LC-MS/MS串联质谱技术,结合数据库比对,对该时期表达的蛋白质进行定性和定量的鉴定分析。检测结果共鉴定到的总蛋白数为1 178个,利用生物信息学进行功能分析,发现这些蛋白广泛参与了细胞信号传递、细胞运动和细胞骨架构建、细胞增殖、细胞分化、物质合成与代谢等各项重要的生命活动过程。研究表明,利用i TRAQ标记的方法可以对4hpf时期的斑马鱼胚胎中的蛋白质进行有效的分离和鉴定,并初步建立了斑马鱼早期发育关键阶段sphere时期的蛋白质组表达图谱,以期为斑马鱼胚胎发育过程中蛋白质组学和调控机制的研究提供参考。
【关键词】斑马鱼 早期胚胎发育 蛋白质组 iTRAQ
【基金】国家自然科学基金面上项目(31572611)
【所属期刊栏目】海洋渔业
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