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小反刍兽疫病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立

2018-12-28分类号:S852.65

【作者】李林杰  刘萍  马鹏  王悦萦  郭富城  马晓霞  周建华  柏家林  
【部门】西北民族大学生物医学研究中心  西北民族大学生命科学与工程学院  中国农业科学院兰州兽医研究所  
【摘要】为了建立一种快速检测小反刍兽疫病毒的方法。根据Gen Bank中公布的PPRV Nigeria75/1株H基因序列设计2对引物,PCR扩增出1 830 bpH基因,构建标准质粒p MD-18-H。以标准质粒优化反应条件,建立了小反刍兽疫病毒H基因SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测方法。最优反应体系25μL:2×SYBR qPCR Mix 12. 5μL,模板DNA 1μL,特异引物各0. 2μL(0. 2μmol/L),DEPC H2O 10. 5μL;最佳反应条件:94℃2 min; 94℃5 s,57℃30 s,40个循环,Ct值与标准质粒模板浓度在3. 28×104~3. 28×10-2copies/μL 7个浓度梯度呈良好线性关系y=-2. 913x+36. 904,斜率为-2. 913,扩增效率120. 5%,相关系数R2=0. 994。建立的实时荧光定量PCR检测方法比普通PCR灵敏度高10 000倍,稳定性好,特异性强,对PPRV的准确诊断和定量检测具有重要意义。
【关键词】小反刍兽疫病毒(PPRV)  SYBR Green Ⅰ  实时荧光定量PCR
【基金】国家自然科学基金项目(31860696);国家自然科学基金项目(31260533);; 西北民族大学“双一流”引导专项-生物工程特色学科(10018703);; 动物医学生物工程创新团队发展计划(IRT_17R88);; 甘肃省科技计划项目(17YF1WA166)
【所属期刊栏目】华北农学报
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