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意大利蜜蜂工蜂中肠发育过程中的差异表达环状RNA及其调控网络分析

2018-12-01分类号:S891

【作者】郭睿  陈华枝  熊翠玲  郑燕珍  付中民  徐国钧  杜宇  王海朋  耿四海  周丁丁  刘思亚  陈大福  
【部门】福建农林大学蜂学学院  
【摘要】【目的】环状RNA(circular RNA,circRNA)在可变剪接、转录调控和来源基因的表达调控等方面具有重要功能。本研究旨在探究意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)工蜂中肠发育过程中circRNA的表达谱及其发育过程中的差异表达circRNA(differentially expressed circRNA,DEcircRNA),进而在转录组水平探究DEcircRNA在中肠发育中的作用。【方法】基于前期获得的意蜂7和10日龄工蜂中肠样品(Am7和Am10)的全转录组数据,利用find_circ软件从质控后的数据中预测circRNA。采用RPM算法归一化处理得到circ RNA的表达量。利用DEGseq软件对circ RNA进行差异分析,按照差异倍数(fold change)≥2、P
【关键词】意大利蜜蜂  中肠  环状RNA  调控网络  发育
【基金】国家现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-44-KXJ7);; 福建省科技计划项目(2018J05042);; 福建省教育厅中青年教师教育科研项目(JAT170158);; 福建农林大学科技创新专项基金(CXZX2017342,CXZX2017343);; 福建省大学生创新创业训练计划(3165602032,3155006018)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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