大黄鱼高温适应的转录组学分析
2018-11-13分类号：S917.4
【部门】集美大学水产学院农业部东海海水健康养殖重点实验室
【摘要】为了探究大黄鱼高温胁迫条件下基因表达水平的变化,实验利用Illumina Hiseq 2500的125 pair-ended测序模式分别对大黄鱼高温处理组和常温对照组进行了转录组测序。对照组(3个生物学重复)和高温处理组(3个生物学重复)分别获得15.28和13.92 Gb测序数据,GC含量平均值约为51%。过滤后的高质量测序reads使用Bowtie2软件比对到大黄鱼参考转录组序列上估计基因表达量,进而进行基因表达差异统计学检验。以常温对照组为参比,高温处理组中阈值设为|log2(FC)|>2和FDR
【关键词】大黄鱼 转录组测序 差异表达基因 qRT-PCR
【基金】国家自然科学基金(31172397);; 福建省高校新世纪优秀人才支持计划(JA14167)~~
【所属期刊栏目】水产学报
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