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环介导等温扩增法(LAMP)检测最短尾短体线虫

2018-11-12分类号:S432.45

【作者】刘星彤  林柏荣  廖金铃  卓侃  
【部门】华南农业大学农学院  洛阳科技职业学院  广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室  
【摘要】为了快速、简便、准确地检测重要植物病原线虫—最短尾短体线虫(Pratylenchus brachyurus),依据GenBank中短体线虫的线粒体DNA细胞色素氧化酶I(mtDNA COI)序列,设计了扩增最短尾短体线虫的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)引物,并对LAMP反应条件进行优化,成功建立了一种可特异、快速检测最短尾短体线虫的LAMP体系。该体系在64℃下反应60min,扩增效率最高。用琼脂糖凝胶电泳、酶切分析和SYBR Green Ⅰ染色均能特异检测到最短尾短体线虫的扩增产物。所建立的LAMP体系能从供试的9种短体线虫和另外10种植物线虫中特异检测出最短尾短体线虫,其灵敏度可检测到1/200条线虫DNA,是常规PCR的10倍。表明本研究建立的最短尾短体线虫的LAMP检测体系,可用于最短尾短体线虫的快速检测。
【关键词】最短尾短体线虫  环介导等温扩增  线粒体DNA细胞色素氧化酶I  快速检测
【基金】国家自然科学基金项目(31471750);; 广东省林业科技创新专项(2015KJCX045)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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