【摘要】优化内部治理结构是新时代高职院校实现高质量发展的必然要求。通过对全国268所高职学校调查发现,我国高职院校内部治理架构基本建立,但运行过程中仍存在诸多机制性障碍,章程制定的程序失当、效力不高,相关权力未形成合力,基层学术组织缺失和空化,多元共治的格局尚未形成。完善高职院校内部治理结构需要高度重视章程建设质量,明晰党委权力、行政权力、学术权力、民主权力等边界,构建新型的基层治理架构。