中药青天葵黄酮醇合成酶基因的克隆与生物信息学分析
2018-10-28分类号:S567.239
【部门】广东医科大学 广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心 岭南中药资源教育部重点实验室
【摘要】【目的】克隆中药青天葵黄酮化合物生物合成途径的关键调控酶—黄酮醇合成酶(flavonol synthase,FLS)基因并分析其序列特征及编码蛋白的功能。【方法】在前期青天葵转录组测序获得的FLS基因序列片段的基础上,通过cDNA末端快速扩增技术(RACE-PCR)克隆FLS基因的cDNA全长及其编码区;利用生物信息学方法对其编码蛋白进行同源性比对和功能分析。【结果】青天葵FLS基因cDNA全长1268 bp,其中包含993 bp的开放阅读框,编码331个氨基酸。编码蛋白的氨基酸序列预测显示,青天葵FLS蛋白为酸性、亲水性蛋白,分子量约为37.3 kDa;不含有信号肽、转运肽和跨膜结构域,可能定位于细胞质中;具有黄酮醇合成酶保守功能域,与铁皮石斛等同科植物FLS蛋白的同源性可达82%。【结论】成功克隆了青天葵黄酮醇合成酶基因,为后续的基因功能鉴定和生物合成调控,进而提高青天葵黄酮类药效成分积累奠定了基础。
【关键词】黄酮醇合成酶 青天葵 克隆 生物信息学分析
【基金】广东省自然科学基金博士启动项目(2015A030310519);; 广东省普通高校创新团队项目——中药资源创新研究团队(2016KYTD02)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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