基于16S rRNA和COI基因序列的柔鱼亚科系统进化关系探讨
2018-09-15分类号:S917.4
【部门】中国水产科学研究院东海水产研究所农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室
【摘要】测定了柔鱼亚科(Ommastrephinae)中的柔鱼(Ommastrephes bartramii)、茎柔鱼(Dosidicus gigas)、鸢乌贼(Sthenoteuthis oualaniensis)、发光柔鱼(Eucleoteuthis luminosa)的线粒体COI和16S rRNA基因的部分序列,结合从Gen Bank中获得的玻璃乌贼(Hyaloteuthis pelagica)、鸟柔鱼(Ornithoteuthis volatilis)、大西洋鸟柔鱼(Ornithoteuthis antillarum)的同源序列,以太平洋褶柔鱼(Todarodes pacificus)、阿根廷滑柔鱼(Illex argentinus)为外群,运用贝叶斯法(BI)构建了分子系统树,同时联合了2个基因片段序列,运用贝叶斯联合模型综合探讨了柔鱼亚科种类的系统发育关系。研究发现,除16S rRNA基因外,COI基因片段和联合模型所构建的系统树拓扑结构完全一致;结合形态学资料,发现玻璃乌贼、发光乌贼和鸢柔鱼亲缘关系较近,且形态上都出现了外套膜大型发光器,是柔鱼亚科中分化较晚的种类;其次茎柔鱼、柔鱼与其它种类存在较大的遗传距离,形态上丢失了内脏和眼球发光器,可能预示着柔鱼亚科种类一个新的进化方向;鸟柔鱼属两个种为柔鱼亚科中最原始种类,且为褶柔鱼亚科向柔鱼亚科进化过程中的过渡物种。
【关键词】柔鱼亚科 线粒体DNA 贝叶斯分析 系统进化关系
【基金】中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(2015T03);; 中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(2014A11);; 科技基础性工作专项子课题-东海重要渔业生物DNA条形码信息采集(2013FY110700)
【所属期刊栏目】海洋渔业
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