中国沿海紫蛤属的系统发育
2018-09-08分类号:S917.4
【部门】中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室
【摘要】紫蛤属(Sanguinolaria)贝类具有很高的经济价值,长期以来却存在着物种鉴定错误、种名使用混乱、同物异名等一系列问题,关于其系统分类和演化问题的研究较少。为探究中国沿海紫蛤属的系统发育关系,本研究利用两个线粒体基因(COI和16S rRNA),以及两个核基因(H3和28S rRNA)的部分序列,对采自中国沿海紫蛤属3亚属9种紫蛤61个个体进行系统发育分析。基于4个基因片段联合数据集T12(剔除COI第三位密码子位置)构建系统发育树。结果表明,两个线粒体基因片段GC含量明显低于AT含量,表现出对AT偏斜,两个核基因表现出对GC的偏斜。4个基因片段(COI、16S rRNA、H3和28S rRNA)的颠换与转换比值分别为5.073、3.042、1.564和1.480,均远高于系统分析的临界值0.4,能够提供有效的系统发育信息。基于4个基因片段的遗传多样性分析表明,9种紫蛤均具有较高的核苷酸多样性(Pi<0.05)与单倍型多态性(Hd
【关键词】紫蛤属 COI 16S rRNA H3 28S rRNA 系统发育
【基金】山东省重点研发计划项目(2016ZDJS06A06);; 中央高校基本科研业务费专项(201762014)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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