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PCR-DGGE指纹图谱技术分析发病龙须菜附生菌菌群组成

2018-09-08分类号:S917.3

【作者】裴鹏兵  陈洋  邓绍鸿  刘晓娟  钟名其  林琪  杜虹  
【部门】汕头大学理学院生物系广东省海洋生物技术重点实验室  福建省水产研究所福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室  汕头大学理学院汕头大学-马尔凯理工大学藻类联合研究中心  
【摘要】本研究以07-2品系龙须菜(Gracilaria lemaneiformis)为实验材料,提取自然条件下代表不同病变程度的健康、病间、白化藻体的附生菌DNA,经PCR扩增16S r DNA基因的V3可变区并进行变性梯度凝胶电泳(DGGE),分离V3片段,再对目的条带进行克隆鉴定。实验结果经数据化后计算龙须菜附生菌数目并比较附生菌菌群多样性,通过非度量多维尺度分析(n MDS)及多元梯度分析(RDA)来比较附生菌菌群组成相似性及优势菌群。实验结果表明,随着龙须菜病变程度的加深,附生菌菌落数及菌群多样性逐渐增加(P
【关键词】龙须菜  白化病  附生菌菌群  变性梯度凝胶电泳  优势菌
【基金】广东省海洋渔业科技与产业发展专项项目(A201405B06);; 福建省海洋生物增养殖与高值化利用重点实验室开放课题基金项目(2016fjscq02)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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