猪圆环病毒2型SYBRGreen Real-time qPCR检测方法的建立
2018-08-28分类号:S852.651
【部门】河南省农业科学院河南省动物免疫学重点实验室农业部动物免疫学重点实验室 郑州大学生命科学院 河南农业大学牧医工程学院
【摘要】为了建立一种基于SYBRGreen的猪圆环病毒2型(PCV2)荧光定量PCR诊断方法,以PCV2 ORF2基因序列为研究对象,构建p MD19T-ORF2重组质粒作为阳性标准品,设计特异性引物,对该方法的最适引物浓度、退火进行了优化,并对该方法的灵敏度、特异性、可重复性以及临床样品检出率进行了评价。结果表明,该方法引物的最佳终浓度为0. 2 mol/L,最适退火温度为55℃;检测限可达到3. 0×10~2个拷贝/mL,而普通PCR检测限在3. 0×10~4个拷贝/mL;溶解曲线分析显示,在77~79℃有单一的溶解峰出现,并与CSFV、PPV、PRRSV、PRV没有交叉反应;组内重复性变异系数为0. 29%~0. 32%,组间变异系数为0. 32%~0. 36%;此外,该方法对临床样品的检出率为81. 5%(31/38),而常规PCR为68. 4%(26/38)。因此,相比常规PCR,该方法更为快速、灵敏、特异、稳定,更适合PCV2临床样品的检测,可为该PCV2早期感染的快速检测提供新方法。
【关键词】猪圆环病毒2型 PCV2 ORF2 SYBRGreen Real-time qPCR
【基金】国家重点研发计划项目(2016YFD0500704);; 河南省重点研发与推广专项(182102110087)
【所属期刊栏目】华北农学报
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