标题
  • 标题
  • 作者
  • 关键词

基于高通量测序分析河北省中南部地区耕地土壤细菌多样性

2018-08-28分类号:S154.3

【作者】张翔  宋水山  黄亚丽  贾振华  黄媛媛  宋聪  
【部门】河北省科学院生物研究所  河北科技大学生物科学与工程学院  河北省主要农作物病害微生物控制工程技术研究中心  
【摘要】为了研究大棚土壤与大田土壤中细菌多样性的差异,利用Miseq高通量测序技术,对河北省南部地区大棚与大田土壤的14个样品进行测序,并得到了2组样品中的物种组成信息与相对丰度信息。结果表明,在大棚(M1)与大田(N1)土壤样品中,优势菌群的组成基本一致,在门水平有变形菌门、放线菌门、酸杆菌门、拟杆菌门、绿弯菌门、厚壁菌门和芽单胞菌门这7个细菌门类,其中,放线菌门在大田中的相对丰度多,厚壁菌门在大棚中的相对丰度较多。在纲水平有α-变形菌纲、酸杆菌纲、γ-变形菌纲、放线菌纲、Δ-变形菌纲、β-变形菌纲、芽单胞菌纲、纤维粘网菌纲等15种优势菌群,其中,大棚中相对丰度明显增高的是纤维黏网菌纲、杆菌纲和黄杆菌纲等,而相对丰度明显降低的是酸杆菌纲和β-变形菌纲等。在属水平有节细菌属、鞘氨醇单胞菌属、德沃斯氏菌属、芽孢杆菌属、黄单胞菌属和溶杆菌属6个优势菌群,其中,节细菌属在大田中较多,而芽孢杆菌属、黄单胞菌属和溶杆菌属在大棚中较多。另外,一些具有固氮和降解修复能力的菌群在大田中的相对丰度要高一些。这应该是由大田与大棚不同的种植环境导致的。研究结果对改善耕地土壤,提高产量与抗病能力有一定的价值。
【关键词】高通量测序  大棚土壤  大田土壤  细菌多样性
【基金】河北省科技条件建设项目(16967518D);; 河北省科技基础资源共享专项科技基础条件建设项目(17962907D)
【所属期刊栏目】华北农学报
文献传递