二倍体和四倍体泥鳅全基因组DNA甲基化的比较
2018-08-17分类号：S917.4
【部门】华中农业大学水产学院/农业动物遗传育种与繁育教育部重点实验室
【摘要】以二倍体和四倍体泥鳅为研究对象,采用甲基化修饰依赖性内切酶测序技术(MethylRAD-Seq)在全基因组水平上分析泥鳅的DNA甲基化特点及倍性间的DNA甲基化变异。测序结果共得到302 111 684条Methyl-RAD序列标签。与参考基因组比对结果显示,泥鳅的甲基化位点主要分布在基因体区(gene body),其次为内含子区(intron)和基因间区(intergenic),而在其他功能元件上的分布较少。四倍体泥鳅的整体甲基化水平比二倍体高,尤其是在第一外显子区(1st Exon)和转录起始位点上游1 500bp至200bp区(TSS1500),且倍性间差异极显著(P
【关键词】泥鳅 二倍体 四倍体 DNA甲基化 MethylRAD-Seq
【基金】国家自然科学基金项目(31472267)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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