谷子eIF5A基因家族鉴定与分析
2018-07-28分类号:S515
【部门】北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心农业基因资源与生物技术北京市重点实验室 北京农学院植物科学技术学院 内蒙古师范大学生命科学与技术学院
【摘要】【目的】本文系统分析了谷子e IF5A基因家族在谷子中如何发挥作用。【方法】利用谷子基因组数据库,运用生物信息学方法,鉴定谷子e IF5A基因家族的基因结构、染色体定位、编码蛋白和磷酸化位点预测,通过序列比对进行进化和分类分析。【结果】谷子含有4个e IF5A基因,均含有4个内显子,分布于谷子的3条染色体上。MEME保守基序分析显示,谷子e IF5A蛋白均含有1个保守的DNA结合寡核苷酸结合结构域(PF01287)。磷酸化位点预测分析表明谷子e IF5A蛋白均含有大量潜在磷酸化位点。【结论】以上结果将为今后揭示谷子e IF5A蛋白功能提供重要的线索。
【关键词】谷子 eIF5A 基因家族 进化分析
【基金】北京市科技计划(Z161100000916003);; 北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20140202);北京市农林科学院青年科研基金(QNJJ201504)
【所属期刊栏目】西南农业学报
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