牛ODF2和PDF2转录组测序筛选卵泡发育的相关基因
2018-07-18分类号：S823
【部门】山西农业大学生命科学学院 山西农业大学动物科技学院
【摘要】为研究牛卵泡发育过程中影响卵泡发育的重要调控基因及其表达模式,通过B超声波监测并采集牛卵泡发育波中出现偏差期后的第二大卵泡(ODF2)和偏差期前的第二大卵泡(PDF2),建立卵泡颗粒细胞RNA文库并进行高通量测序;测序结果经数据库搜索和差异表达筛选,采用DAVID软件GO和KEGG通路分析,再经Gene Cards功能查询筛选牛卵泡发育的相关基因.结果表明:转录组测序共获得35 325个基因,其中,高表达基因15 536个,进一步筛选出504个差异表达基因;GO分析表明,504个差异表达基因中参与生物过程的基因占39.49%,细胞组分占46.96%,分子功能占13.55%;KEGG通路分析表明,共有97个差异表达基因通过10条信号通路参与牛卵泡发育调控(P
【关键词】牛 偏差期后的第二大卵泡(ODF2) 偏差期前的第二大卵泡(PDF2) 转录组 发育 功能
【基金】国家自然科学基金资助项目(31402156);; 山西省回国留学人员科研项目(2014-重点5);; 山西省国际科技合作项目(201603D421006);; 山西省三晋学者和人才引进项目;; 山西省重点研发计划(一般)农业项目(201703D221020-1);; 山西农业大学创新项目(zdpy201403/201503);; 引进人才博士科研启动基金项目(2014ZZ04);; 青年拔尖创新人才支持计划项目(TYIT201403)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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