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珙桐DiCCoAOMT1基因的克隆及生物信息学分析

2018-07-04分类号:S792.99

【作者】吴小波  李梅  李萌  董旭杰  彭继庆  胥雯  曹福祥  
【部门】中南林业科技大学生命科学与技术学院  
【摘要】种子休眠期长是导致珙桐自然繁殖力低下的重要原因之一。珙桐内果皮在发育后期快速木质化形成坚硬而致密的结构,可能是决定种子休眠时间的重要因素,而这一过程的调控机制尚不明确。本研究小组前期通过对珙桐内果皮发育的4个时期进行转录组测序,发现CCo AOMT基因家族与内果皮快速木质化关系密切。本研究从转录组中筛选到11个珙桐CCo AOMT基因家族基因,并利用生物信息学方法对筛选到的基因进行表达模式、序列特征、细胞定位和系统进化分析。分析显示,11个珙桐CCo AOMT基因根据表达模式可分为2种类型,筛选其中6个表达差异显著的CCo AOMT基因进一步分析其表达规律,最后确定其中差异表达最显著的Cluster-149.63013序列进行克隆及生物信息学分析。结果表明,该基因开放阅读框全长为744 bp,编码247个氨基酸,其氨基酸序列含有植物甲基化酶所共有的A、B、C基序及CCo AOMT蛋白特有的标志性序列D、E、F、G和H,其氨基酸序列与辣椒的CCo AOMT蛋白同源性最高,将其命名为Di CCo AOMT1。本研究克隆得到的Di CCo AOMT1基因可能是珙桐内果皮木质素快速积累的关键调控基因。
【关键词】珙桐  CCoAOMT基因  木质素  种子休眠
【基金】国家“十三五”重点研发计划项目(2016YFD0600102);; 湖南省教育厅优秀青年项目(17B282);; 湖南省研究生创新基金项目(CX2016B332);; 中南林业科技大学研究生创新基金项目(CX2016B21);中南林业科技大学青年科学研究基金项目(QJ201512)
【所属期刊栏目】中南林业科技大学学报
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