蓝塘猪和长白猪骨骼肌差异表达cis-NATs基因鉴定
2018-05-14分类号：S828
【部门】华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室 生猪健康养殖协同创新中心 农业部猪健康养殖重点实验室广西扬翔股份有限公司
【摘要】【目的】通过分析蓝塘猪和长白猪生长发育过程中品种间骨骼肌组织差异表达基因及顺式天然反义转录本(cis-natural antisense transcripts,cis-NATs),并以此为基础进行整合分析,探索cis-NATs调控猪骨骼肌生长发育的分子机理。【方法】使用差异表达分析鉴定蓝塘猪和长白猪胚胎期35 d至出生后180 d共10个时间点品种间差异表达基因及cis-NATs(|log2FC|≥1且FDR<0.01);然后通过功能富集分析注释出差异表达基因及cis-NATs对应的正义基因主要参与的GO生物学过程(P<0.01)及KEGG通路(P
【关键词】蓝塘猪 长白猪 顺势天然反义转录本 差异表达 能量代谢
【基金】国家自然科学基金项目(31672391,31601920);; 国家“863”项目(2013AA102502)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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